医院概况
1970年9月，医院前身-云南省交通中心医院创建。
1990年，医院成为云南省血栓病医院。
1995年，医院被评定为三级乙等综合医院。
2015年，医院经省卫计委复评审确定为三级乙等综合医院。
2018年6月13日，医院正式成为云南中医学院第二附属医院，保留“云南省血栓病医院”牌子。
2019年1月，医院随上级学院升级更名为云南中医药大学第二附属医院。
医院编制床位455张，配有菲利普DSA、西门子核磁共振、东芝80排螺旋CT、东芝彩超、奥林巴斯电子腹腔镜、电子胃肠机、ＧＥ公司ＤＲ、上下康复机器人等医疗设施。
医院是昆明医科大学实习医院。
重点专科
医院设有血栓一科、血栓二科、血栓四科、内科、外一科（普外科、泌尿外科、神经外科）、外二科（骨伤科、疼痛科）、妇产科、儿科、五官科、口腔科、康复科（治未病科）、康复治疗中心、重症医学科（ICU）、麻醉科、急诊科、门诊、健康管理中心、功能科、医学影像科、检验科、输血科、药剂科、消毒供应室等临床科室和医技科室。
医院临床特色科室：血栓病专科、康复科。
一、优势病种：脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血、头晕、头痛、焦虑、抑郁、失眠、运动神经元病、痴呆、多系统萎缩、颅内感染性疾病、帕金森病、癫痫、周围神经疾病、脊髓病变、脱髓鞘疾病、肌肉疾病、鼾症、癫痫、高血压、冠心病、心力衰竭、肺炎、慢性阻塞性肺疾病、呼吸衰竭、甲状腺疾病、糖尿病、慢性胃肠道疾病、消化道出血、带状疱疹、关节炎。
二、优势技术：静脉溶栓、动脉溶栓、脑动脉机械取栓血管再通术、动脉支架血管成形术、脑动脉瘤介入栓塞术、血管畸形介入栓塞术、冠脉PIC、中医中药、针灸、电热针、推拿、拔罐、刮痧、脊柱四肢骨折内外固定术、髋关节膝关节置换术、神经血管修复、皮瓣转植皮、骨髓炎病灶清除、椎间盘微创消融术、经皮椎间盘切除术、颈腰椎间盘化学溶盘术、胸腰椎骨折椎体成型术、半月神经节毁损术、鞘内吗啡泵镇痛技术、椎间孔镜下椎间盘摘除术。
